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Este problema es debido a que existen dos clases que extienden de la clase Application En VAADIN.

Otra posible causa es la falta de un setCompositionRoot(panel); si estas usando una clase q extiende CustomComponent, por ejemplo:

public class LoginBox extends CustomComponent implements Navigator.View{

Panel panel;

public void init(Navigator navigator, Application application) {

esta linea es requerida aqui--------setCompositionRoot(panel);